La Ley Universitaria N° 13417 del 8 de abril de 1960, autoriza su reapertura con el nombre de UNIVERSIDAD NACIONAL SAN CARLOS DE PUNO, concretándose con la Ley 13516 (10 de febrero de 1961); siendo el principal gestor el entonces Senador por Puno, lng° Enrique torres Bel6n.

En abril de 1962, con la denominación de UNIVERSIDAD NACIONAL TÉCNICA DEL ALTIPLANO y bajo el gobierno de una Junta Ejecutiva, inicia sus actividades académicas con la Facultad de Ingeniería Agropecuaria. En agosto de 1964. se crea la Escuela de Ciencias Económicas y Comerciales y en enero de 1965 la Escuela de Enfermería.

Posteriormente, por mandato de la Primera Asamblea Universitaria del 22 de abril de 1965, la Facultad de Ingeniería Agropecuaria se desdobla en las Facultades de Agronomía y Medicina Veterinaria. y la Escuela de
Ciencias Económicas .y Comerciales adquiere el rango de Facultad. A partir de 1965 las autoridades universitarias fueron elegidas por la Asamblea Universitaria y los respectivos Consejos de Facultad; según mandato de la Ley Universitaria N° 13417. Por Ley N° 15632. la Escuela de Servicio Social de Puno pasó a formar parte de la Universidad Técnica del Altiplano-Además se puso en funcionamiento la carrera corta de Topografía dentro de la Facultad de Ingeniería Agronómica.

A comienzos de !a década del 70, la Facultad de Ciencias Económicas y Comerciales se desdobla en Ingeniería Económica y Contabilidad; al igual que las otras Facultades adoptan la denominación de Programas Académicos en concordancia a lo dispuesto por la Ley General de Educación. (D.L. N° 19326), que establece el funcionamiento de los Programas y Departamentos Académicos en lugar de las anteriores Facultades.

En 1974, por acuerdo del Consejo Ejecutivo, se crean los Programas Académicos de. Ingeniería de Minas, Biología Pesquera y el Programa Académico de Sociología. En 1979, se aprobó la creación del Programa
Académico de Educación.

Por acuerdo del Consejo Ejecutivo del 28 de abril de 1981. se crearon 10 Programas Académicos: Ingeniería Agrícola, Nutrición Humana. Turismo. Antropología, Estadística. Ingeniería Química, Ingeniería Geológica e Ingeniería Metalúrgica. En 1982, es reaperturado el Programa Académico de Ciencias Jurídicas y Políticas, Ciencias de la Comunicación, sobre la base del convenio suscrito entre esta Universidad y la Asociación Nacional de Periodistas, Asimismo, en 1984. se creó la Escuela de Post-Grado.

Con la Promulgación de la Ley Universitaria N° 23733 (diciembre de 1983). se establece una nueva estructura académica y administrativa para las universidades del país. En el aspecto académico, en lugar de los programas se restablecen las Facultades como unidades de organización y formación profesional, en tanto que subsisten los Departamentos Académicos como unidades de servicio Mediante esta Ley, se norma su
denominación como UNIVERSIDAD NACIONAL DEL ALTIPLANO-PUNO

En 1984 se crea la carrera Profesional de Educación Física, dentro de la Facultad de Ciencias de la Educación. En enero 1991, se acuerda la creación de la Facultad de Ingeniería Civil y Arquitectura. conformada por la Carrera Profesional de Ingeniería Civil y por la Carrera Profesional de Arquitectura y Urbanismo.

En 1992,.se ha puesto en funcionamiento la Carrera Profesional de Ingenieria Agro industrial (R.R. N° 1054- 91-R-UNA) En lugar de Tropicultura y la Carrera Profesional de Ciencias de la Comunicación (R.R, N° 219-83-R-UNA) por la de Periodismo. Asimismo, se puso en funcionamiento la Facultad de Ingeniería Agrícola con la carrera del mismo nombre por Resolución de Asamblea Universitaria N° 03-91-AU-UNA.

El avance y la exigencia del desarrollo de la ciencia, en los campos de la electrónica, informática y la telemática, han motivado que la Universidad aperture y cree las carreras profesionales de Ingeniería de Sistemas, Ingeniería Electrónica e Ingeniería Mecánica Eléctrica (R.R. N° 107-94-R-UNA del 25-01-94), del mismo modo. la demanda de ser vicios en la Región ha originado la creación de las carreras profesionales de Odontología (R.R. N° 107-94-R-UNA), Administración (R.R. N°1884-94-R-UNA). Educación Inicial (R.R. 1981-94-R-UNA), Educación Primaria (R.R. No 1982-94-R-UNA). Y en 1997 se crea la Carrera Profesional de Ciencias Físico Matemáticas (R.R. N° 007 5-9 7-R-UNA).